Theo Quyết định số 70/QĐ-HĐQLQ ngày 10/8/2020 của Hội đồng quản lý Quỹ phát triển khoa học và công nghệ, Ban Kiểm soát Quỹ gồm có 03 thành viên như sau:

1. Bà Lê Thị Hồng Vân - Phó Trưởng phòng Tài chính Hành chính - Sự nghiệp Sở Tài Chính: Trưởng Ban kiểm soát Quỹ.

2. Bà Phan Thị Thùy Trang - Trưởng Phòng Quản lý công nghệ và Thị trường công nghệ, Sở Khoa học và Công nghệ: Phó trưởng Ban kiểm soát Quỹ.

3. Ông Nguyễn Hải Hiệp - Trưởng phòng Kế hoạch Tài chính Sở Nông nghiệp và Phát triển nông thôn:  Uỷ viên.